Спасибо. Я вообщем-то уже решил для себя проблему. Поставил контакт лист Modern и настроил его внешне как Classic.

Попробовал отдельно установить новую Миранду с контакт листом Classic и запустил в ней свой профиль. Удивительно, но заработал комментарий к X-статусу. Но вот папки (группы) всё равно не удаляются/не переименовываются. На всякий случай - выбрал в меню "Обновление Miranda LS". Всё равно не помогло.

Кстати, добавлю - не удаляются и не переименовываются любые папки (группы), даже если новую создать.

все я понял в чем дело, по умолчанию в профиле classic включен лист clist_mw, в нем ещё не исправлено удаление групп, переключись на clist_classic